История «Задачи трех тел» начинается в Китае 1960-х годов, во время Китайской культурной революции. Книга открывает виртуальный мир, оставляя в стороне разговоры о мощных научных технологиях, существующих в реальном мире. В книге рассказывается история ученого, который пытается наладить связь с другими цивилизациями и оказывается в ситуации, когда объединяются несколько элементов, влияющих как на человеческую, так и на солнечную систему.

Первая часть книги посвящена истории одного из главных героев — Ван Мао. Ван — физик, который участвует в серии загадочных научных экспериментов, которые в конечном итоге приводят к открытию им новой цивилизации. Однако он начинает ощущать чувство глобальной опасности, когда обнаруживает, что на планете может появиться недружелюбный объект, выражающий так называемую «задачу трех тел», связанную с вопросом о том, как можно предсказать движение трех объектов, когда силы между ними взаимосвязаны.

Вторая часть книги «Задача трех тел» также весьма насыщена повествовательными событиями и философскими вопросами.

В этой части действие продолжается на основе сложных научных и технологических идей, озвученных в первой части, а история переходит на новый уровень, когда человечество начинает взаимодействовать с гораздо более сильной и технологически развитой космической цивилизацией, именуемой «Цивилизацией Трес». Цивилизация Треснеров — разумная раса, живущая на других планетах и ведущая тайную планетарную войну как в рамках собственной «задачи трех тел», так и с человечеством.

В первой части книги рассказывается о жизни главных героев, их отношениях с окружающим миром, а также о внутренней борьбе, которая постепенно начинает определять их судьбу. В этой части читатель знакомится с главными героями и их мировоззрением, на которое большое влияние оказывают внешние обстоятельства, семейные и социальные связи.

В первой части книги излагаются основные темы сюжета: противоречия между человеком и обществом, размышления о любви и ответственности. Персонажи переживают период, когда они пытаются примирить свои личные желания и общественные ожидания, что приводит к многочисленным союзам и внутренним конфликтам. Более того, в этой части они еще не готовы полностью принять свой внутренний мир, часто не понимая, чего именно они ищут.

Во второй части книги сюжет начинает углубляться, а главные герои переживают более сложные и интенсивные внутренние изменения. В этой части в их жизни происходят важные изменения, связанные как с внешним, так и с внутренним миром.

Вторая часть посвящена в основном борьбе главных героев со своими внутренними противоречиями и окружающим миром. Они более четко осознают стоящие перед ними проблемы: проблемы любви, выбора, свободы и ответственности.

В четвертой части книги продолжается углубление тем, начатых в предыдущих частях: внутренний рост, отношение к жизни, вопросы любви и выбора. Теперь герои оказались на важном перепутье, где им предстоит выяснить, как принять и, наконец, примириться со своим прошлым, двигаясь вперед в будущее. В этой части читатель видит, как персонажи не только внутренне преображаются, но и сталкиваются с новыми вызовами в своих отношениях.